巖倉玲音的同學四方田千砂自殺了。沒有任何前兆的自殺事件讓同學們不知所措，一周后，玲音收到了千砂的短信。明明已死的千砂居然以手機短信和玲音開始了交流。回到家，玲音用爸爸給她的電腦開始與千砂聯系。當談及為何自殺時，千砂回答說“因為我已經不需要身體了，沒有身體，我可以在wired網絡之間繼續活著。”不解的玲音繼續調查千砂的事件，發現wired網絡之中隱藏的巨大秘密，玲音自己的身世也出現了謎團。玲音面對網絡世界中的真相，耳邊不斷響起千砂的話“我生存在wired中，因為神在那里。